تتولى هيئة المستثمرين في المنطقة الحرة بالأردن الإشراف على عمليات التخليص الجمركي، حيث تعمل على تسهيل وتسريع الإجراءات لضمان انسيابية حركة البضائع وفق الأنظمة والتعليمات المعتمدة. وتشمل عمليات التخليص تقديم التسهيلات اللازمة للمستثمرين والشركات، والتنسيق مع الجهات المختصة لضمان الامتثال للمتطلبات الجمركية والضريبية. كما تسهم الهيئة في تحسين بيئة الأعمال من خلال توفير خدمات فعالة تدعم الاستثمارات وتُعزز من تنافسية المنطقة الحرة على المستوى المحلي والدولي.