لقد لعبت هيئة مستثمري المناطق الحرة الأردنية دوراً هاماً في تأسيس الاتحاد العربي للمناطق الحرة والذي انضمت إليه الهيئة بعد أن أقره وصادق عليه مجلس الوحدة الاقتصادية العربية التابع لجامعة الدول العربية ومنذ ذلك الحين والهيئة عضو في الاتحاد 45 . يهدف الاتحاد إلى تنمية وتطوير وتنسيق مجالات العمل بين أعضائه، وتوثيق الروابط بينهم، وتحقيق التكامل الاقتصادي بين الدول العربية من خلال ممارسة مهامه واختصاصاته وخبراته، كما تلعب الهيئة دوراً هاماً في تفعيل دور المناطق الحرة من خلال مد جسور التواصل وتعزيز روح التعاون وتقوية الروابط وتعظيم الاستفادة من هذه المناطق وتبادل الخبرات.